Skip to content

Commit

Permalink
Update README.md
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
burcutepekule committed Jun 24, 2020
1 parent 70156c1 commit 0cc5a41
Showing 1 changed file with 5 additions and 5 deletions.
10 changes: 5 additions & 5 deletions README.md
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -49,7 +49,7 @@ Gevseme durumunda coeff<sub>R</sub>(t) = (1/N)r<sub>relax</sub>(t)
Test kapasitesi etkisi (r<sub>test</sub>(t)) : Zamana bagli lognormal bir fonksiyon olarak modellenmistir. Asemptomatiklerin detekte olma oranini etkiler.

#### Test kapasitesinin parametrizasyonu
<img src="https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_23_Jun_2020/FIGS/TESTS_estimate.png" width="625" height="525">
<img src="https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_24_Jun_2020/FIGS/TESTS_estimate.png" width="625" height="525">

## Diferansiyel Denklemler

Expand Down Expand Up @@ -111,22 +111,22 @@ dC(t) / dt = + (r<sub>d</sub><sup>s</sup> + r<sub>test</sub>(t)r<sub>d</sub><
- Hamiltonian MCMC hesaplama acisindan kaynak kullanimi yuksek olan bir algoritma oldugu icin kosma suresi kullanilan isinma evresi (warmup), iterasyon sayisi (iter), ve zincir (chains) sayisina gore degisecektir. Bu parametreler ``model_fitting.R`` dosyasinin icinden degistirilebilir, ve kosma suresi isinma evresi ve iterasyon sayisi kisaltilarak azaltilabilir. Fakat bu kisaltma sonuclarin guven araligini ve sonsal dagilimlarin yakinsama performasini etkileyebilir.

## Projeksiyonlar
### Son Guncellenme Tarihi : 23 Haziran 2020
### Son Guncellenme Tarihi : 24 Haziran 2020

### Populasyon Degerleri

Gevseme analizi : Gevseme 1 Haziran merkezli, karantina etkisine benzeyen bir sigmoidal fonksiyon olarak modellenmistir. r<sub>end</sub> gevsemenin erisecegi maksimum katsayiyi temsil etmektedir.

![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_23_Jun_2020/FIGS/figure_Re_mrelax_2.png)
![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_24_Jun_2020/FIGS/figure_Re_mrelax_2.png)

![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_23_Jun_2020/FIGS/figure_all_mrelax_2.png)
![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_24_Jun_2020/FIGS/figure_all_mrelax_2.png)

### Efektif R
Efektif R iki sekilde hesaplanabilir. Birincisi model ciktisina gore yapilan efektif R hesaplamasidir, fakat bu hesaplama oturtulan egriye gore yapildigi icin son gunlerdeki vaka sayisindaki dalgalanmalarin etkisini icermemektedir.

Dalgalanmalari hesaba katan, daha hassas bir efektif R hesaplamasi icin ``analysis_RE.R`` kod dosyasi kullanilabilir. Bu dosya modele gore hesaplanan seri aralik dagilimini ve gunluk vaka sayisindaki degisimi kullanarak zamana bagli bir efektif R kestirimi yapar.

![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_23_Jun_2020/FIGS/RE_estimate.png)
![Folder Structure](https://github.com/burcutepekule/corona-tr-modeling/blob/master/OUT_24_Jun_2020/FIGS/RE_estimate.png)

#### Referans icin : http://doi.org/10.5281/zenodo.3835635

Expand Down

0 comments on commit 0cc5a41

Please sign in to comment.